Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DOAP06340 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms