Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFNA4P05014 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFNA4P05014 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms