Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTNP04004 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTNP04004 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTNP04004 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTNP04004 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTNP04004 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VTNP04004 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTNP04004 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms