Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA1P02708 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA1P02708 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms