Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMP1P01033 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP1P01033 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms