Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTLL1O95922 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms