Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB2O95900 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms