Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPG5O95196 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG5O95196 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms