Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A2O94788 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms