Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNMDO75829 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNMDO75829 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNMDO75829 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNMDO75829 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNMDO75829 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNMDO75829 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNMDO75829 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNMDO75829 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNMDO75829 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNMDO75829 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNMDO75829 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNMDO75829 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNMDO75829 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNMDO75829 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNMDO75829 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNMDO75829 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNMDO75829 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNMDO75829 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNMDO75829 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms