Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC9O60706 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCC9O60706 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms