Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLIN3O60664 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLIN3O60664 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms