Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLIN1O60240 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLIN1O60240 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms