Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSNA1O43805 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSNA1O43805 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms