Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYTH3O43739 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms