Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATCO43716 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GATCO43716 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATCO43716 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATCO43716 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms