Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRC1O43663 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRC1O43663 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRC1O43663 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRC1O43663 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRC1O43663 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRC1O43663 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRC1O43663 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRC1O43663 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms