Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCXO43602 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCXO43602 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCXO43602 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCXO43602 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCXO43602 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCXO43602 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms