Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms