Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNAB3O43448 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNAB3O43448 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms