Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERI3O43414 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERI3O43414 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms