Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIAH2O43255 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIAH2O43255 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms