Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC1O15269 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms