Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNMO15061 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNMO15061 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNMO15061 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNMO15061 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNMO15061 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYNMO15061 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYNMO15061 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYNMO15061 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYNMO15061 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNMO15061 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNMO15061 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNMO15061 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYNMO15061 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYNMO15061 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYNMO15061 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNMO15061 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYNMO15061 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms