Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms