Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHODO00212 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHODO00212 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHODO00212 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHODO00212 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHODO00212 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms