Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0C1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0C1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0C1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0C1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0C1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0C1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0C1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0C1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0C1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0C1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0C1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0C1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0C1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0C1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0C1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms