Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms