Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms