Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms