Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK3BL2E5RIL1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms