Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf172C9J069 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C9orf172C9J069 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms