Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4DB7Z1M9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms