Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4E1Z4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4E1Z4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
B4E1Z4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4E1Z4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms