Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRRM5B3KS81 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms