Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms