Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRD1A4D1F6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms