Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms