Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms