Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJQ12913 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 MKRN7P-202ENST00000640520 1765 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ADCYAP1R1-202ENST00000396211 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 AC104852.1-201ENST00000518921 1459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 PPP1R17-201ENST00000342032 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 LYPD6-201ENST00000334166 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 GOLM1-202ENST00000388711 3022 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 PSG9-208ENST00000596730 1812 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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