Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZNF461-213ENST00000614133 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RARB-203ENST00000437042 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 FBP2-201ENST00000375337 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TRIM64DP-201ENST00000529289 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 C3orf35-201ENST00000328376 1859 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 OPRM1-204ENST00000360422 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SPIDR-203ENST00000517693 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 CHRNA2-202ENST00000407991 4067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 IGKV3D-20-201ENST00000390270 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 OR7E31P-201ENST00000426212 886 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 MRPS22-202ENST00000465056 1099 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ST3GAL6-207ENST00000468553 715 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 IGKV3-20-201ENST00000492167 400 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 OR7E136P-201ENST00000496207 1015 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 AL645924.1-201ENST00000502641 220 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 PRSS1-207ENST00000619214 787 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 AC026801.3-201ENST00000606401 1565 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ZNF2-203ENST00000614034 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 RBM24-201ENST00000318204 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 DENND2A-209ENST00000496613 3562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 SRRM5-202ENST00000607544 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 PLA2G4C-201ENST00000354276 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 RNA5SP520-201ENST00000516506 113 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 MGAT4EP-202ENST00000549576 936 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 PINLYP-203ENST00000562255 569 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 MIR3943-201ENST00000585069 100 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 AC022150.2-201ENST00000596451 644 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PTPRJQ12913 CATSPERG-202ENST00000409235 3746 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 AC105053.1-201ENST00000366278 1711 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 COQ6-202ENST00000394026 1608 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 ETV1-204ENST00000403685 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPRJQ12913 MED6-202ENST00000430055 1507 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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