Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF2Q9Y5W3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms