Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPO11Q9Y5K1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPO11Q9Y5K1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPO11Q9Y5K1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPO11Q9Y5K1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPO11Q9Y5K1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPO11Q9Y5K1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPO11Q9Y5K1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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