Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms