Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
DCAF1Q9Y4B6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
DCAF1Q9Y4B6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
DCAF1Q9Y4B6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC41.69■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
DCAF1Q9Y4B6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
DCAF1Q9Y4B6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC41.56■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms