Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAD54L2Q9Y4B4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RAD54L2Q9Y4B4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms