Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms