Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms