Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms