Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms